Persona 5 Strikers marca el regreso de The Phantom Thieves of Hearts un año después de los hechos ocurridos en Persona 5. Con el pretexto de aprovechar las vacaciones, el grupo de amigos decide reunirse en Shibuya para comer barbacoa, salir a pasear y pasar buenos momentos sin preocupaciones. Esa es la idea original de los chicos hasta que, después de despertar en el cuarto de terciopelo, nuestro protagonista es alertado del mal que está por venir, lo que se relaciona de inmediato con el comportamiento extraño de los habitantes de Shibuya, que ya investiga la policía y respecto a lo cual nuestros jóvenes héroes son los principales sospechosos. El hecho de que Morgana, Ryuji y nuestro protagonista aparezcan en el Metaverso sin razón aparente toma a todos por sorpresa, y después de conocer a un nuevo enemigo, se las ingenian para regresar a la realidad y alertar al resto del equipo. El plan original cambia entonces y todos se disponen a encontrar el origen de este mal y devolver la tranquilidad a los habitantes de Shibuya; lo que no saben es que eso es sólo el principio de algo más grande que se desata en 6 sitios de Japón, incluyendo Osaka y Sapporo.