Juegas como Adam Jensen, un ex SWAT al que han escogido para supervisar las necesidades defensivas de una de las empresas de biotecnología más experimentales de América. Tu trabajo consiste en proteger los secretos de la empresa, pero, cuando irrumpe un equipo de operaciones encubiertas y mata a los mismos científicos que debías proteger, lo que creías saber sobre tu trabajo cambia totalmente. Herido de gravedad a consecuencia del ataque, no te queda otra elección que implantarte aumentos mecánicos, y pronto te encuentras persiguiendo pistas por todo el mundo, sin saber en ningún momento en quién puedes confiar. En una época en la que los avances científicos convierten a los atletas, los soldados y los espías en seres supermejorados, hay alguien que está trabajando intensamente por asegurarse de que la humanidad sigue un camino determinado. Debes descubrir cuál es ese camino. Porque, al fin y al cabo, las decisiones que tomes y las elecciones que hagas serán las únicas cosas que podrán cambiarlo.